Các đội bóng góp mặt vòng sơ loại thứ 3 Champions League được phân vào 2 nhánh: nhánh gồm các đội VĐQG (Champions Route) và nhánh các đội không VĐQG (League Route).

Ở nhánh các đội VĐQG, Olympiakos chỉ phải gặp đội thắng trong cặp đấu Hapoel Beer-Sheva - Sheriff. Nếu Celtic vượt qua Lincoln sẽ phải đối đầu với đội thắng trong cặp Zalgiris Vilnius - Astana.

Ở nhánh các đội không vô địch, Fenerbarhce sẽ phải đối gặp AS Monaco trong khi Ajax chạm trán PAOK. Sparta Praha gặp Steaua Bucarest còn Shakhtar Donestsk chạm trán Young Boys. 

Kết quả bốc thăm vòng sơ loại thứ 3 Champions Leauge

Lượt đi của các trận ở vòng sơ loại thứ 3 Champions sẽ League sẽ diễn ra vào 26/7 và 27/7. Các trận lượt về sẽ diễn ra vào ngày 2/8 và 3/8.

15 đội thắng ở vòng sơ loại thứ 3 này sẽ cùng 5 đội bóng khác là Man City, Porto, Villarreal, Mochengladbach và AS Roma đá play-off để tìm ra 10 đội thắng sẽ giành vé tham dự vòng bảng Champions League 2016/17.